在公司决议内容仅违反公司章程的情况下，应由股东自行选择是否要求否定公司决议的效力

与公司决议内容违法的情况不同，决议内容违反公司章程属于对公司股东之间的合意的违背。此时应当考虑到公司章程作为规范公司内部关系的自治性规则的性质，处理时更应尊重公司自治和股东自治。 因此，在决议内容仅违反公司章程的情况下，公司法的处理是赋予股东撤销权，由股东自行选择是否要求否定公司决议的效力。