保修期起算时间无法确定，承包人可以主张质量保证金吗？

不可以。

参考案例：（ 2020 ）最高法民终 375 号判决书：对于工程款认定问题。根据《建设工程施工合同》约定，在结算审核定案 20 个工作日内，金鸿宇公司应向泸州七建支付结算总价 98% 的工程款，余 2% 作为质量保修金，保修期满两年，金鸿宇公司支付工程质量保修金的 80% ；保修期满五年的 20 个工作日内，金鸿宇公司支付剩余质量保修金。2018 年 1 月 10 日《建设工程结算书》确定的工程造价为 83008020 元，泸州七建诉请的工程款金额中包含了质量保修金的退还，但因案涉工程未竣工验收，且业主入住使用时间不明，保修期起算时间无法确定，质量保修金依法应暂予扣除，故金鸿宇公司在本案中应支付泸州七建的工程价款为 83008020 × 98% = 81347859.6 元。